Wisła znalazła się w grupie A. Rywalizację o Puchar Ekstraklasy kluby rozpoczną już na początku września.

Grupa A:
Wisła Kraków
Cracovia Kraków
Śląsk Wrocław
Piast Gliwice

Grupa B:
Ruch Chorzów
Górnik Zabrze
Polonia Bytom
Odra Wodzisław

Grupa C:
GKS Bełchatów
Arka Gdynia
Lechia Gdańsk
Lech Poznań

Grupa D:
Legia Warszawa
Jagiellonia Białystok
Polonia Warszawa
ŁKS Łódź

Terminarz rozgrywek o Puchar Ekstraklasy w sezonie 2008/2009:
FAZA GRUPOWA:
1. kolejka – 2/5 września
2. kolejka – 7/9 września
3. kolejka – 30/31 września oraz 7/9 października
4. kolejka – 10/13 października
5. kolejka – 4/5 listopada oraz 18/19 listopada (*)
6. kolejka – 25/26 listopada oraz 2/3 grudnia (*)
* terminy meczów 5 i 6 kolejki będą uzależnione od terminów meczów zespołów uczestniczących w rozgrywkach UEFA.

FAZA PUCHAROWA:
1/4 finału-  24/25  marca i 29/30 marca
1/2 finału – 14/15 kwietnia i 21/22 kwietnia
Finał – 12/13 maja i ew. 25/26 maja

źródło: Ekstraklasa SA
Biuro Prasowe Wisły Kraków SA